当新上任司令官满怀欣喜的来到基地的时候，发现这个基地和想象中的不一样：“为什么我的战舰是妹子啊！”“为什么这些妹子还会开炮啊！”“为什么这里就只有我一个男人啊！”“……” 总之，一个新上任的司令官和一群舰娘的故事就这样开始了。